С 1939 по 1952 гг. базовая и престижная модели DeSoto назывались соответственно Deluxe и Custom. В 1941 г. эти автомобили получили новый кузов в стиле "Rocket", с низкой поясной линией, капотом аллигаторного типа, плоскими передними крыльями и решёткой радиатора из 14-ти изогнутых вертикальных рёбер. Обе серии имели шасси с колёсной базой 121.5" или 139.5" и оснащались рядным 6-цилиндровым нижнеклапанным двигателем объёмом 3738 см3 и мощностью 100 или 105 л.с. На выбор предлагались 3-ступенчатая механическая коробка передач или 4-ступенчатая полуавтоматическая Simplimatic с гидромуфтой Fluid Drive. DeSoto Custom можно было приобрести в виде 3-х или 5-местного купе, кабриолета, 2-дверного седана, 4-дверного 6-оконного седана и 4-дверного 4-оконного седана, а также с длинной базой в виде 7-местного седана и лимузина. За год продажи DeSoto составили 85980 единиц, что поставило марку на десятое место в общеамериканском рейтинге.

Рестайлинг 1942 г. был примечателен установкой всплывающих фар "Airfoil" - впервые на американском автомобиле после Cord 810. DeSoto также получил более массивные бамперы и сплошную "зубастую" решётку радиатора. Судя по сохранившемуся эскизу концепта DeSoto Cyclone, на дизайн модели оказал влияние Алекс Тремулис. Линейка модификаций и типов кузова DeSoto не изменилась, но 6-цилиндровый двигатель был увеличен до 3878 см3 и теперь развивал 115 л.с. За короткий модельный год было продано 24771 автомобилей, и сейчас они ценятся выше, чем другие DeSoto, в основном из-за своих скрытых фар.

После войны марка DeSoto вернулась на рынок с моделями 1942 г., но с тремя оговорками. Во-первых, был пересмотрен дизайн передней части, и на смену всплывающим фарам пришли обычные. Во-вторых, мощность двигателя снизилась до 109 л.с. из-за перехода на низкооктановый бензин. В-третьих, изменились варианты кузова. В линейку Custom вошли 5-местное Club Coupe, кабриолет и 2-х и 4-дверный седаны на шасси с колёсной базой 121.5", плюс 7-местный седан, лимузин и седан Suburban на шасси с колёсной базой 139.5". Новый седан Suburban представлял собой специальную машину для перевозки семи пассажиров и багажа, востребованную в дорогих отелях. Он имел складывающиеся задние сиденья и дополнительную полку для грузов на крыше. В 1947 и 1948 гг. серии DeSoto не изменились. Всего было продано 62860 единиц в 1946-м календарном году, 81752 единицы в 1947 г. и 92920 единиц в 1948 г. Автомобили DeSoto 1941-1948 гг., преимущественно длиннобазные седаны, широко использовались в качестве такси.