В 1958 г. Thunderbird стал другим: из небольшого спортивного автомобиля он превратился в роскошный и стильный дорожный крейсер. Америке не нужен был двухместный спорткар европейского типа, и первым это осознал будущий председатель Ford Роберт Макнамара, который и сделал из Ford Thunderbird второго поколения модель класса Personal Luxury. Новый Thunderbird получил длинный, широкий и низкий несущий кузов без отдельной рамы, что позволило максимально расширить внутреннее пространство, хотя в салоне много места занял высокий трансмиссионный туннель. Торпедо было разделено на две части центральной консолью, а вместо одного дивана автомобиль получил четыре отдельных сиденья.

Колёсная база Ford Thunderbird второго поколения увеличилась до 112" (2845 мм). За квадратную форму кузова модель прозвали "Squarebird". Теперь она была доступна как кабриолет или как хардтоп купе. Последнее отличалось прямоугольной крышей с широкими задними стойками, плоским задним стеклом и панорамным передним. Thunderbird получил встроенную в передний бампер сеточную решётку радиатора, сдвоенные фары с нависающими "бровями" и хромированную отделку дверей в форме стрелы. Сзади сохранились острые плавники, а четыре больших фонаря были объединены в два турбинных блока. В 1959 г. произошли незначительные внешние изменения, в том числе замена сеточной решётки на горизонтальные жалюзи. В 1960 г. появились тройные задние огни, вертикальные полосы на задних крыльях и крестообразная отделка решётки радиатора. За доплату хардтоп можно было заказать с металлическим сдвижным люком на крыше.

Ford Thunderbird 1958-1960 гг. оснащался новым двигателем V8 352 серии FE объёмом 5766 см3, который выдавал 300 л.с. с 4-камерным карбюратором. В 1959 г. в качестве опции был предложен 7-литровый мотор V8 430 мощностью 350 л.с. от Lincoln. Коробок передач было три: 3-ступенчатая механическая, она же с овердрайвом и 3-ступенчатая автоматическая Cruise-o-Matic. В 1958 г. Thunderbird комплектовался независимой подвеской на пружинах спереди и сзади, но такая конструкция оказалась ненадёжной и в следующем году уступила место традиционному ведущему мосту на листовых рессорах. Несмотря на то, что Thunderbird был самым дорогим в модельном ряду Ford, его продажи росли с каждым годом. В 1958 г. было выпущено 37892 ед., в 1959 г. - 67843 ед., а в 1960 г. - 92843 ед. В 1960 г. компания в рекламных целях построила два хардтопа Thunderbird из нержавеющей стали производства Allegheny Ludlum Steel Corporation, стоимостью $35000 каждый.