В 2012 г. Porsche Boxster прошёл комплексную модернизацию и получил новый внутренний индекс - 981. Несущий кузов на центральномоторной платформе был полностью пересмотрен: его конструкция стала легче, колёсная база была увеличена на 60 мм (до 2475 мм), передняя колея - на 40 мм, задняя - на 18 мм. Дизайнеры сделали очертания автомобиля более чёткими, сместили вперёд лобовое стекло и укоротили свесы. Единая крышка для моторного отсека, складного верха и заднего багажника теперь открывалась с помощью электропривода. Для улучшения динамики и управляемости в качестве дополнительного оборудования для Porsche Boxster был предложен пакет Sport Chrono с активными опорами трансмиссии и система Porsche Torque Vectoring (PTV) с механической блокировкой дифференциала.

Porsche Boxster третьего поколения был представлен на Женевском автосалоне 2012 г. В продажу он поступил в двух модификациях: базовой с 2.7-литровым оппозитным 6-цилиндровым двигателем мощностью 265 л.с. и Boxster S с 3.4-литровым мощностью 315 л.с. Благодаря технологии прямого впрыска, системе рекуперации тепловой энергии и устройству старт/стоп расход топлива удалось снизить на 15%, до 7,7 л/100 км и 8,0 л/100 км соответственно. Как и раньше, на выбор предлагались 6-ступенчатая механическая и 7-ступенчатая автоматическая (PDK) коробки передач. В 2014 г. появилась ещё одна модификация с 3.4-литровым мотором мощностью 330 л.с. - Porsche Boxster GTS. Она отличалась аэродинамическими бамперами, спортивной внутренней отделкой из алькантары и 20-дюймовыми чёрными дисками с шинами 235/35 спереди и 265/35 сзади.

Porsche Boxster Spyder был включён в модельный ряд после дебюта на Нью-Йоркском автосалоне 2015 г. Как и в предыдущем поколении, он являлся самой быстрой и лёгкой модификацией Porsche Boxster. В линейке Cayman ему соответствовал Porsche Cayman GT4, с которым он разделял аэродинамические обвесы, заниженную подвеску, самоблокирующийся дифференциал с системой PTV, 3.8-литровый оппозитный 6-цилиндровый двигатель (дефорсированный с 385 до 375 л.с.) и 6-ступенчатую механическую коробку передач. Дисковые тормоза диаметром 340 мм спереди и 330 мм сзади были позаимствованы у Porsche 911 Carrera S, рулевое колесо - у 911 Turbo S. Вес родстера был сокращён за счёт алюминиевых дверей и крышки багажника, лёгких 20-дюймовых дисков и отсутствия такого оборудования, как аудиосистема и кондиционер. Основным отличием версии Spyder от стандартного Porsche Boxster являются крышка моторного отсека с двумя горбами и складываемый вручную мягкий тент.