В 1965 г. Pontiac Grand Prix вместе с другими полноразмерными моделями GM на платформе B-body получил усиленную периферийную раму коробчатого сечения, а вместе с ней - и новый кузов, оформленный в стиле бутылки от "Кока-Колы". Профиль бутылки был получен за счёт изгиба поясной линии над задними колёсами, и зеркального изгиба скульптурной линии, проходившей внизу. Благодаря этому задние крылья имели мускулистый вид, особенно с прикрытыми колёсными арками, а по направлению к передним крыльям боковины сужались, создавая иллюзию динамики. Фронтальный дизайн стал агрессивнее: остроконечный нос, разделённая им на две части решётка радиатора и сдвоенные вертикальные фары с козырьками, как на Pontiac 1963 г. Единственным доступным для Pontiac Grand Prix кузовом оставался 2-дверный хардтоп, который имел угловатую крышу (металлическую или виниловую) с вогнутым задним стеклом, в то время как в других сериях хардтопы оснащались наклонной крышей полу-фастбэк. Grand Prix также отличался минимальной хромированной отделкой, решёткой радиатора с чёрными прямоугольными ячейками и спрятанными за хромированной решёткой задними фонарями.

Колёсная база у Pontiac Grand Prix 1965 г. увеличилась на дюйм, до 121" (3073 мм). Ходовая часть не изменилась: подвеска - независимая спереди и зависимая сзади на винтовых пружинах, тормоза - барабанные гидравлические. Под капотом устанавливался 6.4-литровый двигатель V8 389 с 4-камерным карбюратором, мощностью 333 л.с. с 3-ступенчатой механической коробкой передач или 325 л.с. - с новой 3-ступенчатой автоматической трансмиссией Turbo Hydramatic. За доплату предлагались более мощный вариант V8 389 Tri-Power с тремя 2-камерными карбюраторами (360 л.с.) и 6.9-литровый мотор V8 421 с 4-камерным карбюратором (338 л.с.), Tri-Power (356 л.с.) или Tri-Power HO (376 л.с.). В салоне Pontiac Grand Prix был оснащён панелью приборов из орехового шпона, центральной консолью с тахометром и ковшеобразными передними сиденьями с виниловой отделкой Morrokide. В списке опций появилась автоматическая система климат-контроля от Cadillac, как альтернатива обычному кондиционеру Circ-L-Aire.

В 1965 г. журнал Motor Trend уже во второй раз наградил всю полноразмерную линейку Pontiac титулом "Автомобиль года", сославшись на "стиль и техническое лидерство в разработке персонализированных легковых автомобилей". Продажи Pontiac выросли до 802000 ед., но на дорогую модель Grand Prix приходилось всего 7,2% от этого числа, или 57881 ед. В 1966 г. доля Grand Prix стала ещё меньше - 4,4%, или 36757 ед. Изменения 1966 г. были чисто косметическими: чёрная решётка радиатора с закруглёнными краями, пересмотренные задние фонари и ребристые алюминиевые панели на порогах. Комплектация была такой же, как в 1965 г., только теперь покупатель мог выбирать между ковшеобразными сиденьями Strato и сплошным диваном с центральным подлокотником.

В 1967 г. у Grand Prix стало ещё больше различий с другими полноразмерными сериями Pontiac, по крайней мере стилистических. Вместо стандартных вертикальных фар он получил горизонтальные, скрытые за решёткой радиатора, интегрированной в передний бампер, а вместо Г-образных задних фонарей - двойные горизонтальные полоски. 2-дверный хардтоп по-прежнему отличался особой формой крыши, но в линейке появился и второй кузов - 2-дверный кабриолет. В связи с корпоративным запретом использования тройных карбюраторов (Tri-Power) на Grand Prix были установлены два новых мотора: 6.6-литровый V8 400 мощностью 265 или 350 л.с. и 7-литровый V8 428 мощностью 360 или 376 л.с. Автомобиль также был оснащён скрытыми стеклоочистителями, энергопоглощающей рулевой колонкой и двухконтурной тормозной системой. За доплату были предложены передние дисковые тормоза, колёса Rally II и 8-трековый стереомагнитофон. Продажи Grand Prix в 1967 г. выросли до 42981 ед., что составляло 5,3% от общего объёма производства.

В 1968 г. кабриолет из линейки Pontiac Grand Prix был исключён. Автомобиль остался практически без изменений, за исключением пересмотренного переднего бампера с клетчатой решёткой радиатора и ярко выраженным центральным "клювом" из ударопоглощающего пластика. Мощность 7-литрового мотора V8 428 была увеличена до 375 л.с. в базовой настройке или 390 л.с. - в улучшенной. Как и раньше, Grand Prix был комфортабельным автомобилем для водителя с хорошей управляемостью и плавностью хода, но его продажи упали до критической отметки - 31711 ед. Тогда под руководством Джона ДеЛореана компания разработала новый Grand Prix для 1969-го модельного года, основанный на среднеразмерной платформе A-body.