В 1938 г. Studebaker Commander вернулся в производственную программу после двухлетнего отсутствия, чтобы заменить модель с неудачным названием Dictator. Он поступил в продажу в двух сериях: Commander и State Commander. Последняя отличалась полуинтегрированными фарами (как у President), улучшенной внутренней отделкой, муфтой свободного хода и устройством Hill Holder в качестве стандартного оборудования. Обе серии были основаны на шасси с колёсной базой 116.5" и оснащались рядным 6-цилиндровым двигателем L-head объёмом 3703 см3 и мощностью 90 л.с., а также независимой передней и зависимой задней подвеской на рессорах, амортизаторами Houidalle, гидравлическими барабанными тормозами и штампованными колёсами Budd. На выбор предлагались четыре пассажирских (3-местное Business Coupe, 2-дверный Club Sedan, 4-дверный Cruising Sedan, 4-дверный Convertible Sedan) и два коммерческих (5-дверный универсал Station Wagon, 2-дверный пикап Coupe-Express) кузова. Цены варьировались от $965 до $1375.

В 1939 г. студия Раймонда Лоуи обновила дизайн старших моделей Studebaker с помощью таких решений, как заострённый нос, разделённая на две части решётка радиатора и полностью интегрированные овальные фары. Изменения в салоне включали пересмотренную панель приборов, рычаг 3-ступенчатой механической коробки передач на рулевой колонке и опциональный отопитель Climatizer под передним сиденьем. В 1940 г. единственным заметным новшеством стали круглые фары. В линейке Commander остались только Club Sedan и Cruising Sedan, зато теперь они были доступны в версии Delux-Tone с окраской крыши другим тоном.

В 1941 г. модели Commander и President получили интегрированные подножки, скрытые дверные петли, выпуклые задние крылья с защитными накладками, гнутое заднее стекло, сужающуюся полоску из нержавеющей стали вдоль всего корпуса (в версии Delux-Tone она окрашивалась в цвет крыши), низкую решётку радиатора из двух частей и панель приборов в одну линию, с горизонтальным спидометром. 3.7-литровый 6-цилиндровый двигатель Studebaker Commander теперь развивал 94 л.с., а 4.1-литровый 8-цилиндровый мотор Studebaker President - 117 л.с. Колёсная база составляла 119" и 125" соответственно.

Обе модели поступили в продажу в двух типах кузова от фирмы Budd: 4-дверный Cruising Sedan (с шестью боковыми окнами и "самоубийственными" задними дверями) и 4-дверный Land Cruiser (с четырьмя боковыми окнами и передненавесными дверями). Оба предлагались в уровнях отделки Custom и Delux-Tone. К концу года появилась третья модификация под названием Skyway, которая отличалась отсутствием боковых полосок, хромированным обрамлением окон, юбками на задних колёсах, белыми боковинами шин, "двухэтажными" бамперами и ребристыми щитками задних крыльев. В серию Skyway вошёл шестиместный 2-дверный кузов Sedan-Coupe, оснащённый цельным гнутым лобовым стеклом - впервые в своей ценовой категории. За год компания продала 133997 автомобилей, в том числе 41998 ед. Studebaker Commander и 6999 ед. Studebaker President.

Для 1942-го модельного года Studebaker Commander был оборудован цельной горизонтальной решёткой радиатора в мелкую клетку с интегрированными противотуманными фарами и более массивными бамперами. В серию по-прежнему входили три кузова (Cruising Sedan, Land Cruiser и Sedan-Coupe) в трёх уровнях отделки (Custom, Delux-Style и Skyway). В списке опций появилась полуавтоматическая трансмиссия Turbo-matic Drive без педали сцепления (состояла из гидромуфты и 3-ступенчатой механической коробки передач с овердрайвом), но из-за вступления США во Вторую мировую войну с ней было выпущено всего шесть автомобилей. Всего до февраля 1942 г. было построено 1688 ед. Studebaker Commander и 408 ед. Studebaker President. После войны корпорация временно отказалась от старших моделей в преддверии полного рестайлинга 1947 г., хотя по официальным данным было продано 45 довоенных машин в 1946 г. и 150 - в 1947 г.