Энцо Феррари построил свой первый автомобиль в 1940 г., но после ухода из Alfa Romeo ему было запрещено использовать своё имя в течение четырёх лет, поэтому он назвал модель AAC (Auto Avio Costruzioni) Tipo 815. Из-за спешки проект оказался неудачным: ни один из двух построенных экземпляров в дебютной гонке Гран-при Брешии 1940 г. не доехал до финиша. Потом началась война, и у Феррари появилось больше свободного времени, чтобы подготовиться к выходу на гоночные трассы. Понимая, что на одних гонках построить бизнес невозможно, он хотел создать универсальное шасси, пригодное как для соревнований, так и для продажи в виде дорожных машин. В 1945 г. Энцо обратился к своему приятелю Джоаккино Коломбо - известному инженеру, который разработал одноместный болид Alfa Romeo 158. Вместе они пришли к выводу, что идеальный спортивный автомобиль должен оснащаться небольшим и лёгким 12-цилиндровым двигателем. Прежде, чем вернуться в Alfa Romeo, Коломбо выполнил основную часть проектных работ. Доводкой мотора занимался уже другой инженер - Аурелио Лампреди, присоединившийся к Ferrari в 1946 г. Затем Феррари заказал фирме Gilco построить два шасси, и к маю 1947 г. были готовы два прототипа: один с обтекаемым кузовом родстер для гонок на выносливость, второй с отдельными мотоциклетными крыльями для Гран-при.

Первая модель Ferrari была обозначена как 125 S (Sport). Число "125" указывало на объём одного цилиндра в см3 (по этому принципу компания называет свои автомобили до сих пор). Двигатель Коломбо V12 был шедевром инженерной мысли. Он имел алюминиевый блок и головки, угол развала 60°, один верхний распределительный вал (SOHC), два клапана на цилиндр и три двухкамерных карбюратора Weber 30 DCF, воздух к которым подавался через трубу коробчатого сечения, соединённую с передним воздухозаборником. Мотор работал в паре с 5-ступенчатой механической коробкой передач (которая подходила ему лучше, чем традиционная 4-ступенчатая) и был установлен на стальную трубчатую раму с колёсной базой 2420 мм. Передняя подвеска была независимой, на двойных поперечных рычагах и поперечной рессоре, задняя - зависимой на продольных рессорах, тормоза - гидравлическими барабанными на всех колёсах.

Дебютный заезд Ferrari 125 S в Пьяченце закончился провалом: автомобиль с мотоциклетными крыльями попал в аварию, а у обтекаемого родстера сильно дымился двигатель. Но уже через две недели Ferrari 125 S и управлявший ею гонщик Франко Кортезе принесли компании первую победу, в Гран-при Рима на трассе Terme di Caracalla Circuit. В середине сезона в команду Феррари снова пришёл Коломбо, чтобы увеличить объём мотора V12 до 1903 см3, а мощность - до 125 л.с. В результате модель переименовали в Ferrari 159 S, и вскоре был построен третий экземпляр, который имел отдельные крылья и фары. В своей первой гонке в Пескаре Ferrari 159 S пришла второй, зато к концу года на Гран-при Турина Раймон Соммер занял первое место. Всего в 1947 г. команда Ferrari выиграла 6 из 14 гонок чемпионата.

Ранние автомобили Ferrari находились в непрерывном развитии, что вызывает определённые трудности для коллекционеров. До наших дней не дошло ни одного экземпляра Ferrari 125 S или Ferrari 159 S, так как они были разобраны на запчасти для создания следующих моделей. Первые два шасси были положены в основу двух родстеров Ferrari 166 Spyder Corsa, один из которых впоследствии был продан частному клиенту как новая машина. Когда тот обнаружил под алюминиевой пластиной с номером "010I" старый штамп "01C", компания сделала ему большую скидку. Через несколько лет автомобиль попал в Англию и получил новый кузов. В таком виде в начале 90-х гг. его выкупила фирма Symbolic Motors. Она объединила оригинальное шасси "01C" с репликой самого первого кузова (с закрытыми колёсами), изготовленной в ателье Michelotto к 40-летию Ferrari. В 2006 г. восстановленная Ferrari 125 S была представлена на конкурсе элегантности в Пеббл-Бич, но судьи даже не стали рассматривать её на предмет аутентичности.